本會成立於民國57年9月6日，成立之前，本市船務代理同業即定期在中山北路美而廉餐廳聚會，聯絡情誼，交換業務經驗與航運情報，商討共同性問題，至57年由參加聯誼聚會之同業發起，依法令規定籌組同業公會，民國63年依經濟部「商業團體分業標準」更名為「台北市船務代理商業同業公會」，以促進航業發展，協助政府推行航運政策及政令，維持增進同業共同利益。